該劇以明代武林為背景，以暗器為線索，講述了冷兵器向熱兵器的過渡。
身為名門正派的仲裁堂出了兩個“異類”，一個是仲裁熊云錚（欒浚威飾演），一個是仲查葉藏飛（趙鴻飛飾演），兩人雖出身不同卻“物以類聚”親如兄弟，受滿口宣揚武林正統(tǒng)的同道中人所排斥，熊云錚在五年前斷一宗暗器案之后竟深深迷戀上暗器，認為暗器也應歸為武林正統(tǒng)，直至從秘密渠道搞到火槍，癡迷于此，后被同門設計暗算死于火槍之下，葉藏飛終將兇手捉拿兇器查明，為兄弟報仇并一心想恢復武林秩序，對火器甚是排斥，但最終也無奈命喪火器之下。誰也無法阻止時代的進步，《暗器》帶你見證中國兵器的進化史。